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Programas de facturación para autónomos: los 9 mejores de 2026

Aviso de transparencia: este artículo incluye enlaces de afiliado. Si contratas a través de ellos recibimos una comisión, sin coste adicional para ti. No cambia el orden ni nuestra valoración: verás puntos negativos de las nueve opciones, y la primera recomendación es gratuita y no nos paga nada.

Veredicto rápido. Si facturas poco, la aplicación gratuita de la AEAT o Contasimple gratis te bastan. Si buscas el mejor precio con funciones completas, Anfix. Si quieres que los impuestos salgan solos, Quipu. Si vas a crecer hacia inventario o equipo, Holded. Si facturas desde la calle, STEL Order.

Ahora bien, antes de nada hay algo que debes saber sobre las comparativas de este sector, incluida esta.

El problema de las comparativas de programas de facturación

Al revisar los rankings mejor posicionados encontramos un patrón muy claro: casi todos están publicados por uno de los programas comparados. Y, curiosamente, siempre gana el que publica.

Dos ejemplos concretos y comprobables: un ranking de los diez mejores programas de facturación de 2026 está publicado en el blog de Billin, y su primera posición es Billin. Otra comparativa de los diez mejores programas está publicada por STEL Order, y su primera posición es STEL Order.

No es mala fe. Es lógica comercial y, además, esos artículos suelen tener información útil. Pero significa que no puedes fiarte del orden de ninguna lista.

Lo que sí encontramos como buena práctica: algunos análisis independientes declaran expresamente sus enlaces de afiliado, indicando que la comisión no cambia la posición ni la valoración. Ese es el estándar que hemos adoptado aquí.

Nuestra recomendación de método: fíate de los criterios, no del orden. Y comprueba siempre los precios en la web oficial.

Cómo hemos comparado

Hemos cruzado tres tipos de fuente: análisis publicados por fabricantes (identificando quién publica cada uno), reseñas independientes con declaración de afiliación, y comparativas de terceros.

Advertencia importante sobre los precios. Se contradicen mucho entre fuentes. Para un mismo programa y un mismo perfil hemos encontrado diferencias de más del triple. Lo detallamos en un apartado propio. Trata las cifras de este artículo como orden de magnitud, nunca como tarifa.

Los 6 criterios que importan de verdad

Antes de mirar precios, filtra por esto. Te ahorrará el 90 % de los errores de elección.

1. Que cumpla Verifactu, y en qué plan. Es el criterio innegociable de cara a 2027. Ojo con un detalle: en algunos programas, la funcionalidad Verifactu solo está disponible en los planes de pago, no en el gratuito. Compruébalo antes de instalarte en un plan gratuito pensando que ya estás cubierto.

2. Que cubra también la factura electrónica estructurada. Es una obligación distinta que llegará después. Un programa que resuelva ambas te evita cambiar dos veces.

3. Que puedas exportar tus datos. Compruébalo antes de entrar, no cuando quieras irte.

4. Que tu gestoría trabaje con él. Pregúntaselo antes de contratar. Si puede entrar directamente, te ahorras el envío trimestral entero.

5. El precio real: con IVA y a doce meses. Muchas tarifas anunciadas son sin IVA y con pago anual.

6. Que lo contrates tú, no tu gestoría. Si el software es de tu asesor, cambiar de asesor implica migrar de sistema.

Los 9 programas, uno a uno

1. Aplicación gratuita de la AEAT — la gran ignorada

Para quién: autónomos con pocas facturas al mes que solo necesitan emitir y cumplir.

Precio: 0 €.

Lo bueno: cumple por definición, porque la desarrolla la propia Administración. No dependes de ningún proveedor ni de ninguna suscripción.

Lo malo: según los análisis consultados, se limita a facturación básica, un solo usuario, y no gestiona tickets ni gastos. Tampoco lleva contabilidad ni calcula impuestos.

Veredicto: aparece en muy pocas comparativas, y el motivo es evidente: no genera comisiones. Si emites diez facturas al mes de servicios y tu gestor lleva los gastos, es una opción perfectamente digna. Comprueba sus condiciones vigentes en la sede electrónica de la AEAT.

2. Contasimple — el mejor precio con funciones completas

Para quién: autónomos que quieren pagar poco sin renunciar a modelos fiscales.

Precio: plan básico gratuito con facturación básica, registro de gastos y un número limitado de facturas al mes. El plan Profesional aparece en 10,95 €/mes más IVA, e incluye facturación ilimitada, los modelos fiscales completos (303, 130, 115), conciliación bancaria automática y la funcionalidad Verifactu.

Lo bueno: relación precio-funciones difícil de igualar. El plan gratuito es una opción real para quien empieza.

Lo malo: interfaz menos cuidada que competidores más caros. Las opciones de personalización son limitadas.

Veredicto: la opción por defecto si el precio manda y quieres cubrir la parte fiscal.

3. Anfix — el más barato de los completos

Para quién: autónomos que quieren contabilidad y tesorería de verdad sin pagar de más.

Precio: desde 5,99 €/mes según los análisis consultados.

Lo bueno: incorpora contabilidad y tesorería completas, integra con bancos y recibe muy buenas valoraciones en atención al cliente. Además, es habitual entre asesorías, lo que facilita la conexión con tu gestor.

Lo malo: menos conocido que Quipu o Holded, con menos contenido de ayuda disponible en internet.

Veredicto: el mejor precio por función de la lista. Pregunta a tu gestoría si trabaja con él: si la respuesta es sí, es una elección muy sólida.

4. Billin — el más sencillo para empezar

Para quién: freelances y consultores que solo quieren facturar rápido y bien.

Precio: plan gratuito con hasta 3 clientes activos. Los de pago se citan desde 7, 8 o 9,99 €/mes según la fuente.

Lo bueno: de los más fáciles de usar desde el primer día. Lector de gastos por OCR, app móvil y buena atención al cliente.

Lo malo: Verifactu solo en planes de pago, según uno de los análisis consultados. Y sin inventario, sin contabilidad completa y sin ERP.

Veredicto: excelente puerta de entrada. Verifica ese detalle de Verifactu si piensas quedarte en el plan gratuito.

5. Quipu — el que resuelve los impuestos

Para quién: autónomos sin gestoría que quieren reducir al mínimo el trabajo fiscal.

Precio: aparece en 13 €/mes en un análisis y desde 17 €/mes en otro, con 15 días de prueba sin tarjeta y Verifactu incluido.

Lo bueno: facturación, gastos e impuestos en un mismo panel. Conexión bancaria desde el plan básico, buen reconocimiento de documentos y presentación de modelos.

Lo malo, y aquí una reseña independiente es bastante explícita: precio regular más alto que Billin, Anfix o Contasimple; en el plan de entrada el soporte es solo por correo; el reconocimiento de gastos falla o duplica en ocasiones según las reseñas; API limitada y sin contabilidad de doble partida, es decir, no es un ERP.

Veredicto: buena elección para el autónomo medio que valora simplicidad y soporte, siempre que el precio encaje.

6. Holded — el que escala cuando creces

Para quién: pymes con equipo, inventario o varias líneas de negocio.

Precio: aquí está la mayor discrepancia de toda la comparativa. Un análisis lo sitúa en 7,50 €/mes para autónomos y 14,40 € para empresas; otro, entre 14 y 50 €; y una reseña independiente afirma que el plan de autónomo cuesta 29 €/mes. Confírmalo directamente.

Lo bueno: es un ERP completo, con facturación, contabilidad, CRM, inventario, proyectos y recursos humanos. Evita cambiar de herramienta cuando el negocio se complica.

Lo malo: mayor curva de aprendizaje y, para un autónomo que solo factura servicios, la mayor parte sobra y encarece.

Veredicto: la diferencia no está en facturar, donde todos cumplen. Está en lo que ocurre antes y después: si la contabilidad se genera sola, si el stock se actualiza al facturar. Si eso no te aplica, no pagues por ello.

7. Cuéntica — el enfocado al autónomo de servicios

Para quién: autónomos y pequeños negocios que quieren seguimiento contable y fiscal sin complicaciones.

Lo bueno: solución ágil, con seguimiento contable y fiscal automatizado y un enfoque muy centrado en el profesional individual.

Lo malo: menos funciones de gestión que las opciones tipo ERP.

Veredicto: alternativa razonable a Quipu si buscas algo con orientación similar.

8. STEL Order — el de la movilidad

Para quién: instaladores, técnicos y comerciales que facturan fuera de la oficina.

Lo bueno: gestión de facturación, inventario y clientes con app móvil pensada de verdad para trabajar en la calle. Permite crear facturas, presupuestos y albaranes desde el móvil.

Lo malo: más orientado al servicio técnico y al comercio que al despacho profesional.

Veredicto: si facturas de pie en casa del cliente, es de las pocas diseñadas para eso.

9. Sage 50 y Factusol — los clásicos de instalación local

Para quién: quien prefiere el programa instalado en su ordenador y no en la nube.

Lo bueno: software con años de rodaje y gran estabilidad. Sage 50 añade contabilidad, inventario y control financiero para pymes con necesidades avanzadas.

Lo malo: menos ágiles en movilidad y con más curva de aprendizaje. Además, un análisis señala que Factusol no se integra con TicketBAI, el sistema obligatorio en el País Vasco.

Veredicto: válidos si ya trabajas así y solo quieres cumplir sin cambiar de forma de trabajar.

Tabla comparativa de precios

ProgramaPlan gratuitoDesdeMejor para
App de la AEATSí, íntegro0 €Emitir y cumplir, sin más
ContasimpleSí, limitado~10,95 €/mes + IVA (Profesional)Precio ajustado con modelos fiscales
AnfixNo~5,99 €/mesContabilidad completa barata
BillinSí (3 clientes)~7-9,99 €/mesEmpezar sin complicarse
QuipuNo~13-17 €/mesImpuestos automatizados
HoldedNo~7,50-29 €/mesCrecer hacia ERP
CuénticaNoConsultarAutónomo de servicios
STEL OrderNoConsultarFacturar en movilidad
Sage 50 / FactusolNoConsultarInstalación local

Precios recopilados en agosto de 2026 de fuentes de terceros, frecuentemente sin IVA y con pago anual. Confirma siempre en la web oficial.

Cuál elegir según tu caso

Tu situaciónRecomendación
Menos de 10 facturas al mes, solo serviciosApp gratuita de la AEAT
Empiezas y facturas a pocos clientesBillin gratuito o Contasimple gratis
Quieres el mejor precio con funciones completasAnfix
Priorizas precio y necesitas modelos fiscalesContasimple Profesional
No tienes gestoría y quieres automatizar impuestosQuipu
Tienes o tendrás inventario, equipo o proyectosHolded
Facturas desde casa del clienteSTEL Order
Prefieres programa instaladoSage 50 o Factusol
Tienes gestoríaPregúntale primero con cuál trabaja
Estás en País Vasco o NavarraComprueba compatibilidad con TicketBAI o el sistema foral

Las discrepancias de precio que hemos encontrado

Las exponemos porque afectan directamente a tu decisión:

Holded. Aparece con 7,50 €, con 14-50 € y con 29 € para el plan de autónomo, según la fuente. Puede tratarse de planes distintos o de promociones, pero la diferencia es demasiado grande para darla por buena.

Quipu. Citado en 13 € y en 17 €.

Billin. Citado en 7, 8 y 9,99 €. Además, un análisis indica que Verifactu solo está en los planes de pago, dato que no aparece en otras fuentes.

Contasimple. Desde 3 €, en torno a 8 € y 10,95 € + IVA según la fuente y el plan.

Qué hacer con esto: elige dos finalistas con los seis criterios del principio, entra en sus webs oficiales, apunta el precio con IVA a doce meses y comprueba en qué plan está Verifactu. Aprovecha las pruebas gratuitas: varios ofrecen entre 14 y 15 días sin tarjeta.

Cómo cambiar de programa sin perder datos

Si vas a migrar, hazlo así:

  1. Exporta todo del programa actual: clientes, productos, facturas emitidas e histórico.
  2. Elige el momento: el 1 de enero, con las series de facturación limpias.
  3. Mantén el programa antiguo activo unos meses en modo consulta.
  4. Avisa a tu gestoría antes, no después.
  5. Guarda tu propia copia del histórico. La obligación de conservación es tuya, no de tu asesor.
  6. Emite tres facturas de prueba y comprueba numeración, envío y, cuando aplique, el código QR.

Preguntas frecuentes

¿Cuál es el mejor programa de facturación para autónomos?
Depende del volumen. Con pocas facturas, la app gratuita de la AEAT cumple. Con volumen y sin gestoría, Quipu. Buscando el mejor precio con funciones completas, Anfix o Contasimple.

¿Hay programas de facturación para autónomos gratis de verdad?
Sí. La aplicación de la Agencia Tributaria es gratuita, y Contasimple y Billin tienen planes gratuitos con límites de facturas, clientes o funciones.

¿Todos cumplen con Verifactu?
Los que aparecen aquí lo cumplen o están adaptándose, pero no siempre en el plan gratuito. Comprueba en qué plan está incluido antes de contratar.

¿Cuánto cuesta un programa de facturación al mes?
La horquilla realista va de 0 € a unos 30 € para un autónomo. Por encima de eso ya estás pagando funciones de ERP.

¿Puedo cambiar de programa más adelante?
Sí, siempre que puedas exportar tus datos. Compruébalo antes de empezar a cargar información.

¿Me sirve el mismo programa para la factura electrónica obligatoria?
No necesariamente. Son obligaciones distintas. Pregunta expresamente si cubrirá también el formato estructurado.

¿Debo contratarlo yo o mi gestoría?
Contrátalo tú. Si el software es de tu asesor, cambiar de asesor te obliga a migrar de sistema.

Fuentes consultadas

Comparativas publicadas por fabricantes (lo señalamos porque condiciona el orden de sus rankings):

  • Billin: ranking de los diez mejores programas de facturación de 2026, encabezado por Billin.
  • STEL Order: comparativa de los diez mejores programas, encabezada por STEL Order.
  • FactuPro: alternativas a Holded para autónomos, con datos del plan gratuito de Billin.

Análisis independientes con declaración de afiliación

  • GuíaFiscal (julio de 2026): reseña de Quipu con precios, limitaciones concretas y recomendación explícita de la app gratuita de la AEAT para quien factura poco. Declara sus enlaces de afiliado.
  • Cronomia (junio de 2026): análisis de Contasimple con detalle de planes y del contenido del plan Profesional.

Otros análisis de terceros

  • Rankia Business (agosto de 2026) y HerramientasNegocio (abril de 2026): precios y perfiles de uso.
  • ERPiA (junio de 2026): comparativa que incluye la aplicación gratuita de la AEAT.

Nota de método. Ninguno de estos precios ha sido verificado por nosotros directamente en las webs oficiales el día de publicación. Proceden de análisis de terceros de 2026 y varios se contradicen entre sí, con diferencias de hasta el triple para un mismo producto. Los presentamos como orden de magnitud, con la recomendación explícita de confirmarlos antes de contratar. Las condiciones de la aplicación gratuita de la AEAT deben consultarse en su sede electrónica.

Última revisión: agosto de 2026. Próxima revisión prevista: noviembre de 2026.

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